Kierownikiem Zakładu Farmacji Stosowanej jest prof. dr hab. Maciej Małecki.
Zakład Farmacji Stosowanej prowadzi przede wszystkim kształcenie studentów bezpośrednio związane z pracą farmaceutów w aptekach otwartych oraz szpitalnych. Prowadzone zajęcia pozwalają przygotować studentów z zakresu receptury aptecznej, sporządzania postaci leków do oczu, leków pediatryczych, parenteralnych, stomatologicznych i leków w układach dyspersyjnych. Szczególny nacisk pokłada się w przygotowanie studentów do pracy w aptece. Zakład uczy jak prowadzić aptekę otwartą (nauka programów komputerowych, obieg recept, obecność w ekspedycji aptecznej, asertywność zawodu farmaceuty). Zakład prowadzi fakultatywny blok programowy Kosmetologia z elementami medycyny estetycznej.
Badania naukowe w Zakładzie to praca związana z lekiem eksperymentalnym głównie w zakresie chorób nowotworowych i naczyniowo-sercowych. Badania prowadzone są w oparciu o unikalne procedury, z wykorzystaniem metodologii inżynierii genowej oraz biologii komórki. Zakład opracowuje formulacje farmaceutyczne dla preparatów genowych plazmidowych oraz wirusowych. Badania prowadzone są in vitro, jak i z udziałem zwierząt laboratoryjnych. Szczególne zainteresowanie dotyczy terapii genowej i wektorologii rAAV.